在合金弹头5中，玩家需要完成一些特定的标准或者通过特定的方法来解锁隐藏关卡。以下是解锁每个隐藏关卡的方法。
解锁合金弹头5里隐藏关卡的方法：
1. 迷彩型企鹅谜：在第一关机场随机发生，可以通过踩下某一位置的数字按钮打开。
2. 次要门潜入：在第一关下A中吸毒，瞬移到一列火车上，直到最后瞬移区的前岔口向右潜入。
3. 黑暗的地下墓穴：在第三关B的中途，战胜一群黑袍守护后，可以打开激光门。
4. 超级时空战斗机：第四关B结束后，进入新启动的秘密基地，找到并摧毁地图标记？”建筑物就可以了。
5. 高贵的谜宫：在第五关B结束后，找出唯一突出的地形并通过，以后再处理Boss。
6. 海龙王秘藏室：第七关B结束后，击败Boss后跳进龙头口进入，注意不断移位。
7. 火山基地前线:第九关B结束后，找一个避开火雨的洞。进去后一定要带一把长武器塞进洞里，不然就死了。
8. 神秘的地下城市：用导弹或长枪打破路面，在第十二关下A的终点，然后进入新的通道。
9. 失落的沙漠遗迹：在第15关B结束后，调查一些机构就可以找到隐藏的大关。
10. 电子岛密境：在二十关下B的中途，一边开车一边穿过路桩，一边跳下悬崖。
